Acredito que as heresias são sempre as mesmas que se repetem em diversas épocas da história, com diversas roupagens.
As mais graves e que sempre ameaçaram a cristandade:
Gnosticismo: está ligada à busca do conhecimento que não foi-nos revelado diretamente por Deus. É a heresia que surgiu no Éden e que vemos em religiões pagãs (como o hermetismo) ou mesmo no misticismo judaico (cabalistas e essênios) e cristão (cátaros e maniqueístas). Religiões e seitas ocultistas podem ser classificadas como gnósticas no sentido de buscarem conhecimento e contato com o mundo metafísico que não foi-nos autorizado a conhecer ou acessar.
Arianismo: heresia que declara Jesus como criatura e não Deus. Religiões ou seitas que não aceitam a Santíssima Trindade caem nesta heresia. Testemunhas de Jeová, Islamismo e acredito que Espiritismo também possa ser classificado como arianismo.
Relativismo: esta é uma heresia sorrateira. O relativismo se revela na adaptação e na mudança de interpretação de princípios e dogmas que deveriam ser imutáveis. Ele não nega afrontosamente dogmas ou princípios da fé cristã, mas muda a interpretação deles e a relação deles com o mundo de forma gradual. Esta heresia manifesta-se em abusos doutrinários e abusos litúrgicos dentro de uma mesma corrente teológica.
Diferença teológica não é relativismo. Por exemplo: para os cristãos reformadores, católicos são considerados heréticos, por entenderem que a cristandade deveria voltar a um cristianismo primitivo e bíblico, sem "penduricalhos" e "inovações teológicas". E católicos acreditam que Cristo guia a humanidade pelos milênios por meio da sua Igreja e que despojar da sua tradição e doutrina é negar a autoridade de Cristo na história da humanidade.
Então surge aí duas correntes teológicas na cristandade ocidental, porém o relativismo acontece dentro de cada uma delas.
Um exemplo pessoal: embora eu nunca tenha sido evangélico, estudei em colégio presbiteriano e tenho parentes de igrejas como TJ's, Adventista e a minha mãe neopentecostal. E isto me permite observar como a Igreja Presbiteriana é bem diferente da Igreja Mundial do Poder Deus e como estas duas são diferentes dos Adventistas. Acredito que Lutero e Calvino não imaginaram que as denominações teriam diferentes interpretações hermenêuticas e teológicas a ponto de chegar a abusos modernos que algumas praticam.
E entre os católicos, principalmente após o Concílio Vaticano II, os tradicionalistas questionam os posicionamentos da Igreja pós conciliar perante o mundo moderno, mudanças significativas na liturgia e a introdução do movimento carismático entre os fiéis.